副本是玩家获取资源、提升战斗熟练度的重要途径。游戏内的副本分为多种类型，包括日常副本、周常副本、特殊活动副本等。日常副本如秋日秘径、黄沙戈壁、高地工厂等，每日可挑战一次，主要奖励战斗熟练度、新币和基础材料。周常副本如密斯卡大学、黑泥沼等，每周刷新次数，奖励更为丰厚，包含专研材料、高级装备配件等。特殊活动副本通常与版本主题活动相关，如危海寻晶、幽灵据点等，限时开放且机制独特。
副本的难度根据玩家采集等级动态调整，建议组队挑战以提高通关效率。部分副本存在特殊机制，例如黑泥沼需要避开教徒干扰，危海寻晶需利用属性克制关系击败BOSS。装备配置上，霰弹枪、狙击枪等武器适用性较广，而护甲和护盾的星级直接影响生存能力。副本中还需注意弹药补给、凝固剂等消耗品的合理使用，避免因资源不足导致失败。
部分副本如密斯卡大学、沙石堡战役等，对玩家操作和团队配合要求较高。密斯卡大学需分工清理感染者并保护NPC，沙石堡战役则需应对佣兵狙击手的集中火力。低等级玩家可通过匹配系统加入高等级队伍，但需注意自身输出不足可能影响团队评分。副本奖励通常与伤害贡献挂钩，因此提升装备属性、优化技能加点是提高收益的关键。
探索隐藏机制能进一步提升副本效率。危海寻晶副本中利用坦克载具可快速清理母巢，空岛阶段需精准跳跃避免落水。部分副本如幽灵据点存在隐藏宝箱，触发条件需完成特定任务或击败隐藏怪物。交易之城可出售副本产出的异变核芯等稀有道具，为玩家提供额外金条来源。
副本玩法是明日之后的核心内容之一，兼顾挑战性与资源收益。玩家需根据自身等级和装备水平选择合适难度，并逐步掌握机制细节以实现高效通关。
